Cerita novel Santri Pilihan Bunda berpusat pada karakter Aliza Shaqueena Iqala, seorang gadis cantik pecandu batu es serta pemilik bulu mata lentik nan cantik. Hari-harinya yang biasa mendadak penuh kejutan manakala Ia harus menikah dengan santri yang dipilih bundanya. \
Rencana perjodohan ini tak pernah ada dalam bucket list Aliza, jangankan menikah dengan orang yang baru dikenal, menjalin hubungan asmara dengan lelaki yang sudah dikenal saja merupakan hal asing baginya.
Ialah Kinaan Ozama El Fatih, santri pilihan bunda yang bakal jadi imam dalam hidup Aliza. Pria beralis tebal ini memiliki postur tubuh tinggi dengan paras yang boleh dibilang tampan nyaris tiada tanding, ya setidaknya dalam kehidupan Aliza. Pria yang terbiasa bersikap dingin ini mampu menjadi sosok yang hangat bagi Aliza. Meski harus menikah melalui jalan perjodohan, Kinaan memperlakukan Aliza dengan penuh kasih.